Indiana Jones wordt naar Londen geroepen om een oud manuscript op te sporen. Dat manuscript zou niet alleen de formule bevatten om lood in goud te veranderen maar ook het recept voor een eeuwig leven kunnen geven! Indy is er zeker van dat een vermiste Britse alchemist en een krankzinnige geleerde verantwoordelijk zijn voor de diefstal van het manuscript, en hij besluit hen op te sporen. Natuurlijk niet alleen: de beeldschone dochter van de alchemist vergezelt hem. Samen vertrekken ze naar Rome waar ze in handen vallen van de fascisten van Mussolini.

Maar Indy zou Indy niet zijn als hij niet in zijn missie zou slagen. Hij vindt het manuscript, dat een kaart blijkt te zijn die de weg wijst naar de oudste, magnifiekste graftombe van de wereld. Daar zal Indy ofwel een wonder van alchemie aanschouwen, ofwel voor eeuwig gevangen zitten...

Indiana Jones en de Steen van de filosoof is een nieuw spannend deel rondom 's wereld beroemdste archeoloog: Indian Jones.