Het huis aan de Prinsengracht speelt zich af rond de Tweede Wereldoorlog. Het verhaal wordt gedragen door de wereld van die tijd, een wereld waarin de verschillen in geloof worden uitvergroot en de verschillen in welstand bepalend zijn voor de positie die men in de maatschappij inneemt. In die wereld komen Anne Marie en haar vader Klaas tegenover elkaar te staan. De spanning komt voort uit het verschil tussen de geslachten, karakter en de rol in de oorlog.