In een vervallen boerderij, dichtbij alles wat spannend was, woonde een muizenfamilie. Zo begint het verhaal van Piepmuis, Troetelmuis en Spookmuis. De drie kleine muisjes hebben geen gewoon muizenleven, maar beleven de meest fantastische avonturen: Ze sluiten vriendschap met de eenzame zwerver Kobus, die net als de muisjes dol is op kaas. In het kabouterpaleis van koning Appeltaart worden de muisjes in de vergeetmachine gestopt. Piepmuis raakt hierbij zijn geheugen kwijt. Zal hij dit nog terugvinden? Ook gaan ze de strijd aan met een wijze, hongerige uil en springen de muisjes trampoline op een spinnenweb. Dan komt oom Hannes, kapitein op de grote vaart, bij de muizenfamilie op bezoek. Hij vraagt vader en moeder Muis toestemming om zijn drie neefjes als bemanning mee te nemen. De muisjes gaan als matrozen aan boord van een onderzeeër.

Dat is het begin van nog veel meer belevenissen van Piepmuis, Troetelmuis en Spookmuis