De rechtszaak tegen Brendan Quillian belooft een ongewoon proces te worden. Brendan Quillian staat terecht voor de brute moord op zijn vrouw, hoewel hij de dag van de moord op reis was. Alexandra Cooper, de jonge officier van justitie is van plan aan te tonen dat hij een moordenaar inhuurde, maar ziet zich daarbij geconfronteerd met een formidabele tegenstander en het niet onbelangrijke feit dat ze slechts over een handjevol aanwijzingen beschikt.
Tijdens het proces wordt New York opgeschrikt door een enorme ontploffing die de constructie van watertunnel 3, bijna tweehonderd meter onder straatniveau, lamlegt. Was het een terroristische aanslag? Een politieke wraakactie? Een ongeluk? Alexandra ontdekt al snel een vreemd verband tussen de tunnelwerkers en haar verdachte, Brendan Quillian. Ze moet diep onder de grond om de gevaarlijke watertunnels van New York City te onderzoeken en het rottende lijk van een tweede moordslachtoffer uit te graven.
In rap tempo ontvouwt zich een mysterie waarbij het verborgen verleden van New York verweven raakt met een schokkende, hedendaagse zaak, die alleen met de modernste forensische technieken kan worden opgelost.