1958, Buck Danny zet de geheime operatie voort om Amerikaanse atoomgeleerden te redden die in 1951 door de USSR zijn ontvoerd. Niets verloopt echter volgens plan. De spectaculaire ontsnappingen via de lucht volgen elkaar in ijltempo op, en iedere hopeloze situatie wordt op het nippertje gekeerd. Buck en zijn vrienden moeten dus weer alles op alles zetten om uit de handen te blijven van de SMERSJ, de contraspionagedienst van het Rode Leger... Geïnspireerd door authentieke historische feiten is Molotok 41 het vervolg en slot van het tweeluik dat begon met De vlucht van de Rapier.